大型放射光施設 SPring-8

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構造生物学ⅢビームラインBL38B1におけるタンパク質結晶測定代行の実施について

登録施設利用促進機関
公益財団法人 高輝度光科学研究センター

[目 次]

1.タンパク質結晶測定代行について
2.利用時期、対象ビームライン
3.タンパク質結晶測定代行における測定試料
4.利用料金
5.申込方法
6.審査について
7.実施後の流れ
8.その他



1.タンパク質結晶測定代行について

 (公財)高輝度光科学研究センター(JASRI)は、2009Bより共用BL38B1において「タンパク質結晶測定代行」として利用支援を実施しています。
 タンパク質結晶測定代行は医薬品の開発や研究、未知の化学物質や環境物質等の探査に欠かせない生体高分子のX線構造解析を対象とし、JASRIスタッフがユーザーに代わって大型放射光施設(SPring-8)を利用したタンパク質結晶の結晶回折像の測定を行うものです。ユーザーのSPring-8への来所および測定への立ち会いは任意としており、ユーザーは、試料を宅配便等でSPring-8へ送付、または持参するだけで、SPring-8の高輝度X線を利用した世界最高精度の実験結果を得ることができます。放射光を利用したタンパク質結晶構造解析に馴染みのない方はもちろん、利用を常時受け付けることにより、タイムリーに測定したいという経験者の方のご要望にも対応します。実施に関する流れはこちらに記してありますのでご一読ください。なお、本測定代行は『成果専有時期指定課題』の一形態として取り扱い、ビーム使用料および消耗品実費負担についても、当該『成果専有時期指定課題』に準じた金額(「4.利用料金」参照)となります。得られた成果およびその成果に基づく特許権等を独占的に専有することができ、利用申請内容に係わる秘密は保持されますので、情報を開示することなく研究開発等を進めることが可能です。

2.利用時期、対象ビームライン

(1)利用時期
 タンパク質結晶測定代行の申込書は、随時受け付けます。実施可能な日程については、「8.その他(1)タンパク質結晶測定代行の相談窓口」にお問い合わせください。来所の有無、試料によって実施までの事前手続きに要する時間が異なります。各種書類ごとの提出期限は、こちらを参照してください。

(2)対象ビームライン
 BL38B1 構造生物学 III ビームライン 
 なお、施設詳細は、こちらのタンパク質結晶解析推進室のHPをご参照ください。

3.タンパク質結晶測定代行における測定試料

(1)測定試料
 生体高分子結晶のみを取り扱います。JASRIが定める「ランク4」の化学薬品、即ち、取り扱いに際し国または県の許可が必要な以下の物質は、原則として対象外とします。ただし、重金属を含む重原子誘導体等については「8.その他(1)タンパク質結晶測定代行の相談窓口」にご相談ください。
 (i)化学兵器の禁止および特定物質の規制等に関する法律に定める特定物質
 (ii)麻薬および向精神薬取締法に定める麻薬および向精神薬
 (iii)覚醒剤取締法に定める覚醒剤およびその原料
 (iv)大麻取締法に定める大麻草およびその製品
 (v)あへん法に定めるあへん、けし、けしがら
 (vi)薬事法の指定薬物
 (vii)毒物および劇物取締法に定める特定毒物
 (viii)労働安全衛生法に定める製造禁止物質

(2)試料調整
 サンプル自動交換ロボットSPACE(SPring-8 Precise Automatic Cryo-sample Exchanger)を用いた測定になりますので、専用ピンに詰める等事前調整が必要となります。調整方法については、こちらをご覧ください。調整方法が判らない場合は必ず「8.その他(1)タンパク質結晶測定代行の相談窓口」にご相談ください。なお、試料を送付いただく場合も、『タンパク質結晶測定代行』係」と朱書で記入の上、こちらまでご送付ください。

4.利用料金

 利用料金は、次の(1)および(2)の合計金額となります。 

(1)ビーム使用料
 ご利用は2時間単位で受け付け、測定方法、試料数、測定データセット数によりビームタイムが2時間単位で算出されます。「5.申込方法」にある手続きにしたがって、JASRIスタッフと十分に事前打合せを行い、必要ビームタイムをご確認いただきますと、ビーム使用料(時期指定利用 成果専有時期指定料金相当:180,000円/2時間)が算出され、測定代行実施後に徴収します。

(2)消耗品実費負担相当額
 消耗品実費負担相当額として、定額分(2,640円/2時間)および従量分(測定代行中に使用した消耗品等の金額)を徴収します。

5.申込方法

(1)申込受付
 タンパク質結晶測定代行を希望される方は『測定代行申込書(様式A)』により事前にタンパク質結晶測定代行の申込を行っていただき、『仮照射条件指定書(様式A別添1)』にて照射条件を指示していただきます。両書類に必要事項をご記入のうえ、JASRIタンパク質結晶解析推進室宛(mail-in@spring8.or.jp)に申込書をメール添付で送付してください(文書にパスワードをかけ、当該パスワードを担当者まで電話でお知らせいただくことを想定しています)。その際のメール件名は『タンパク質結晶測定代行申込』と記入願います。不明な点がございましたら、「8.その他(1)タンパク質結晶測定代行の相談窓口」までお問い合わせください。

(2)事前打合せ
 申込を受け付けた後、JASRIスタッフがタンパク質結晶測定代行の実施内容に関して事前打合せをいたします(SPring-8へのご来所は任意です)。事前打合せ終了後、JASRIタンパク質結晶解析推進室から申請者に対し『測定代行実施内容等確認書(様式B)』を送付しますので、様式Bに従って次項に示す課題登録を行ってください。

(3)課題登録(オンライン申請)
 以下のWebサイトを利用した電子登録となります。

  User Information Webサイト(UIサイト) : http://user.spring8.or.jp/
  トップページ>マイページにログイン>課題申請/利用計画書>新規作成

 登録には、ユーザーカード番号とパスワードでログインする必要があります。ユーザーカード番号を取得していない方は、ユーザー登録を行ってください。
 ログイン後『成果の形態および課題種』の選択画面で“成果を専有する”をチェックし、『測定代行課題』を選択してください。『測定代行実施内容等確認書(様式B)』に記載された情報に従い、実施予定日10日前(土日祝を除く)の午前10:00までに、オンラインによる課題登録を完了してください。タンパク質結晶測定代行は成果専有利用になりますので、登録の後に、『SPring-8測定代行同意書』を提出していただく必要があります。当該フォームをダウンロード後、料金支払い責任者の記名・押印を得て、「8.その他(2)オンライン課題登録/書類提出に関する問い合わせ先」へ郵送してください。同意書に記入が必要な申請番号は、課題登録完了時にお送りする受理通知メールにてお知らせいたします。

(4)測定代行実施前に必要なオンライン提出書類
  オンラインによる課題登録後、利用推進部から申請者に連絡しますので、下記の2つの提出書類(利用申込書、試料および薬品等持込申請書)をUIサイトからオンライン提出してください。

1)利用申込書
 
 (i)立ち会い者有りの場合:
ユーザーカード・線量計受取/返却日時および研究交流施設利用期間を記入してください。なお、立ち会い者は、来所の10日前までに『外来放射線作業者登録申請書(様式5-1)』の提出が必要です。立ち会いを希望される場合は事前にJASRIスタッフまでご相談ください。
 (ii)立ち会い者なしの場合:
“除外”にチェックを入れ、ユーザーカード・線量計受取/返却日時の項目に『測定代行実施内容等確認書(様式B)』に記載されている実施予定日時を記入してください。
利用申込書を提出していただくと試料および薬品等持込申請書へのリンクが表示されますので、本申請書をオンライン提出してください。

6.審査について

実験の安全性についてのみ審査を行います。実験内容の技術的な実施可能性、社会性、倫理性については、事前打合わせの過程において確認済みのため改めて審査は行いません。また科学技術的妥当性および研究手段としてのSPring-8の必要性に関する審査は行いません。
なお、郵送等が不適切な試料(法令に定める劇物・毒物等)を測定する場合、ユーザー来所による持込みおよび持ち帰りが課題実施の必須条件になる場合がありますので、予めご承知おきください。

7.実施後の流れ

(1)タンパク質結晶測定代行の実施後、申請者に対し、測定データと実施報告書を送付します。測定データは、インターネットでのダウンロード、もしくは申請者から送付された電子媒体に収納し、お渡しします。なお、解析はサービスには含まれておりませんのでご注意ください。解析ソフトの紹介、解析方法の説明などのご相談は、「8.その他(1)タンパク質結晶測定代行の相談窓口」にて承ります。
(2)申請者は、測定データと実施報告書の確認後、ビームタイム利用報告書をUIサイトからオンライン提出してください
(3)試料は測定後に返却いたします。立ち会いがなかった場合、JASRIスタッフが試料を申請者に返送します(送料は申請者負担となります)。試料受領後、JASRIまで『試料等受領書(様式C)』をご返信ください。
(4)利用成果(測定データ)は申請者の所属機関に帰属します。
(5)申請者の所属機関に利用料金の請求書を送付しますので、利用料金をお支払いください。
(6)タンパク質結晶測定代行実施後、測定代行支援の制度化に関するご意見をお聞きしますので、ご協力をお願いいたします。

8.その他

(1)タンパク質結晶測定代行の相談窓口(申込先)
 タンパク質結晶測定代行のお申込、ご質問、試料の事前調整に関するお問い合わせ、試料送付はこちらになります。試料の受け取りは、平日(9時〜17時)のみとなりますので、ご注意ください。
 〒679-5198 兵庫県佐用郡佐用町光都1-1-1
 公益財団法人 高輝度光科学研究センター 
 タンパク質結晶解析推進室 馬場 清喜
  TEL: 0791-58-0833
  e-mail: mail-in@spring8.or.jp

(2)オンライン課題登録/書類提出に関する問い合わせ先
 ユーザー登録やオンライン課題登録/書類提出に関するご質問、測定代行同意書送付先はこちらになります。
 〒679-5198 兵庫県佐用郡佐用町光都1-1-1
 公益財団法人 高輝度光科学研究センター 利用推進部
  TEL: 0791-58-0961
  e-mail: sp8jasri@spring8.or.jp

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