大型放射光施設 SPring-8

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SPring-8研修会「生体高分子結晶解析研修会(初級)」

主題/内容 生体高分子結晶解析研修会(初級)
開催期間 2024年05月28日 (火) 10時00分から29日 (水) 17時30分まで
開催場所 大型放射光施設 SPring-8 BL41XU、蓄積リング棟D10室(タンパク計算器室)、 D34室(結晶準備室)
共催 高輝度光科学研究センター(JASRI)
理化学研究所放射光科学研究センター
大阪大学蛋白研究所
創薬等先端技術支援基盤プラットフォーム(BINDS)
形式 普及・啓蒙(研修会)
分野 生命科学
概要

結晶試料の準備とデータ測定から構造解析・精密化までの一連の実習を行います。

開催日:

  実施日 締め切り
第1回 5/28(火), 5/29(水) 4/26(金)12:00
第2回 10月下旬予定 未定


場所:BL41XU、蓄積リング棟D10室(タンパク計算器室)、 D34室(結晶準備室)


対象:生体高分子結晶構造解析の未経験者、経験があるもののまだ不慣れな初級者を対象にします。


人数: 5名程度


参加費: 無料


申込方法

第1回目の募集は終了致しました。

プログラム

1日目

時間 内容 タイトル
10:00-11:00 講義 生体高分子のX線結晶解析概要
生体高分子結晶構造解析のための試料調製
11:00-12:00 実習 生体高分子の結晶化
12:00-13:00 昼食  
13:00-15:00 実習 生体高分子の結晶化・結晶凍結
15:00-15:30 見学 回折データ測定
15:30-17:30 実習 XDSGUIを用いたデータ処理


2日目

時間 内容 タイトル
9:00-9:30 講義 構造解析・構造精密化について
9:30-12:00 実習 CCP4I2を用いた構造解析 ー 分子置換法・モデル構築・構造精密化
12:00-13:00 昼食  
13:00-17:00 実習 CCP4I2を用いた構造解析 ー 分子置換法・モデル構築・構造精密化
17:00-17:30 閉会 SPring-8利用制度、Q&A

結晶化の実習では、参加者自身が研究室でも実施可能な基本的な結晶化実験ができるように蒸気拡散法による標準蛋白質の結晶化を行います。また結晶化ロボットを利用した結晶化条件スクリーニングを見学します。
回折実験のための試料準備、いわゆる結晶凍結は抗凍結剤の選択や凍結操作などノウハウを必要とする部分が多いため、実際に操作を行いながら回折実施可能な凍結結晶を用意することができることを目指します。

データ処理、構造解析の実習は、参加者一人に一台づつLinuxPCを使っていただきハンズオンで行います。回折データ処理にはXDSGUI、構造解析にはCCP4I2を使用します。
データ処理・構造解析の際の注意すべき指標の解説、COOTを用いたモデル修正のコツの説明を交えて実習することで、これらソフトウェアを用いて構造解析ができるようになることを目指します。

研修会担当:
長谷川和也 (JASRI)、坂井直樹 (JASRI)


≪その他注意事項≫

1.学生の方は「学生保険」等に加入していることが必要です。

2.参加者への連絡などは全てe-mailで行います。また参加の手続にはオンライン登録が必要です。インターネットに接続できる環境をご用意下さい。

3. SPring-8 にユーザー登録のない方はユーザー登録をした上で参加申込して下さい。ただし、SPring-8 のユーザー登録が研修会に間に合わない場合も参加は可能です。

4. 研究交流施設での宿泊が可能です。ただし施設の運転期間中ですのでSPring-8やSACLAのビームタイム利用者優先となり、満室の場合はご利用いただけません。


≪内容に関する問合せ先(講義・実習担当)≫
(公財)高輝度光科学研究センター
構造生物学推進室
 担当: 長谷川 和也
 TEL:0791-58-0803(内線3595)
 e-mail : stbio@spring8.or.jp

≪手続きに関する問合せ先(事務局)≫
(公財)高輝度光科学研究センター
利用推進部 普及情報課
 担当: 濱本、松末、安藤
 TEL:0791-58-2785
 e-mail : jasri-event@spring8.or.jp

最終変更日 2024-04-26 14:01