2004年後期実施課題2004B一覧：重点タンパク500課題
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| S/N | 課題番号 | 実験課題名 | 実験責任者 | 実施時所属 | 国名 | ビームライン | 実施 シフト数 |
| 1 | 2004B0785-NL1-np-P3k | 脳・神経系に関するタンパク質ホモログの結晶構造解析 | 金谷 茂則 | 大阪大学 | 日本 | BL38B1 | 12 |
| 2 | 2004B0788-NL1-np-P3k | Axin（DIX2）タンパク質のX線構造解析 | 樋口 芳樹 | 兵庫県立大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 3 | 2004B0789-NL1-np-P3k | 膜近傍のシグナル伝達系、レセプター下流のシグナル伝達の構造ゲノム研究 | 神田 大輔 | 九州大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 4 | 2004B0790-NL1-np-P3k | 膜近傍のシグナル伝達系、レセプター下流のシグナル伝達の構造ゲノム研究 | 神田 大輔 | 九州大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 5 | 2004B0795-NL1-np-P3k | 鉄硫黄タンパク質の成熟化に関与するタンパク質群の構造解析 | 福山 恵一 | 大阪大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 6 | 2004B0801-NL1-np-P3k | 抗体を用いたサイトカインおよびその受容体の結晶構造解析 | 黒木 良太 | 日本原子力研究所 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 7 | 2004B0803-NL1-np-P3k | 大腸菌DNAの複製開始及び制御機構の構造生物学的アプローチ | 植田 正 | 九州大学 | 日本 | BL38B1 | 6 |
| 8 | 2004B0806-NL1-np-P3k | 高度高熱菌由来BirAの結晶構造 | 今野 美智子 | お茶の水女子大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 9 | 2004B0807-NL1-np-P3k | ペルオキシソーム局在型4量体カルボニル還元酵素の結晶構造解析 | 田中 信忠 | 昭和大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 10 | 2004B0810-NL1-np-P3k | ビタミンB12補酵素関与ジオールデヒドラターゼの不活性化と再活性化の機構の結晶学的解析 | 虎谷 哲夫 | 岡山大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 11 | 2004B0813-NL1-np-P3k | 好熱性古細菌由来分子シャペロン及び関連タンパク質のX線結晶構造解析 | 養王田 正文 | 東京農工大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 12 | 2004B0815-NL1-np-P3k | 相同組換えに関わるswiのX線結晶構造解析 | 清水 敏之 | 横浜市立大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 13 | 2004B0817-NL1-np-P3k | 核内輸送に関わるtransportinのX線結晶構造解析 | 橋本 博 | 横浜市立大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 14 | 2004B0818-NL1-np-P3k | 核内輸送に関わるtransportinのX線結晶構造解析 | 橋本 博 | 横浜市立大学 | 日本 | BL41XU | 6 |
| 15 | 2004B0819-NL1-np-P3k | 転写、翻訳に関与する蛋白質の構造ゲノム科学研究 | 田中 勲 | 北海道大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 16 | 2004B0820-NL1-np-P3k | 転写、翻訳に関与する蛋白質の構造ゲノム科学研究 | 田中 勲 | 北海道大学 | 日本 | BL41XU | 6 |
| 17 | 2004B0821-NL1-np-P3k | 膜蛋白質分解メタルプロテアーゼFtsHのX線結晶構造解析 | 吉田 賢右 | 東京工業大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 18 | 2004B0822-NL1-np-P3k | 膜蛋白質分解メタルプロテアーゼFtsHのX線結晶構造解析 | 吉田 賢右 | 東京工業大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 19 | 2004B0831-NL1-np-P3k | 超高熱性古細菌由来チオレドキシンペルオキシダーゼの構造決定 | 安宅 光雄 | （独）産業技術総合研究所 | 日本 | BL38B1 | 6 |
| 20 | 2004B0833-NL1-np-P3k | 低温環境生物タンパク質の結晶構造解析に関する研究 | 渡邉 啓一 | 佐賀大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 21 | 2004B0835-NL1-np-P3k | tRNAのコドン特異性とアミノ酸特異性を同時に変換する修飾酵素TilSおよびtRNAとの複合体の結晶構造解析 | 濡木 理 | 東京工業大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 22 | 2004B0836-NL1-np-P3k | tRNAのコドン特異性とアミノ酸特異性を同時に変換する修飾酵素TilSおよびtRNAとの複合体の結晶構造解析 | 濡木 理 | 東京工業大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 23 | 2004B0837-NL1-np-P3k | タンパク質高次構造形成と機能発現に関わるタンパク質群の結晶構造解析 | 三木 邦夫 | 京都大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 24 | 2004B0838-NL1-np-P3k | タンパク質高次構造形成と機能発現に関わるタンパク質群の結晶構造解析 | 三木 邦夫 | 京都大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 25 | 2004B0839-NL1-np-P3k | オートファジーに必須なAtg12系蛋白質群の構造解析 | 稲垣 冬彦 | 北海道大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 26 | 2004B0840-NL1-np-P3k | オートファジーに必須なAtg12系蛋白質群の構造解析 | 稲垣 冬彦 | 北海道大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 27 | 2004B0847-NL1-np-P3k | メッセンジャーRNAの生成（転写）制御、成熟化と輸送、並びに遺伝情報維持に関わるタンパク質の構造生物学 | 山縣 ゆり子 | 熊本大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 28 | 2004B0849-NL1-np-P3k | 枯草菌の分化に関する蛋白質と極限微生物の細胞分裂に関与する蛋白質の構造解析 | 田中 信夫 | 東京工業大学 | 日本 | BL38B1 | 9 |
| 29 | 2004B0850-NL1-np-P3k | 枯草菌の分化に関する蛋白質と極限微生物の細胞分裂に関与する蛋白質の構造解析 | 田中 信夫 | 東京工業大学 | 日本 | BL41XU | 6 |
| 30 | 2004B0851-NL1-np-P3k | 植物種子グロブリンのX線結晶構造解析 | 三上 文三 | 京都大学 | 日本 | BL38B1 | 6 |
| 31 | 2004B0853-NL1-np-P3k | 藍色細菌時計装置のX線結晶構造解析 | 今田 勝巳 | 大阪大学 | 日本 | BL38B1 | 6 |
| 32 | 2004B0854-NL1-np-P3k | 藍色細菌時計装置のX線結晶構造解析 | 今田 勝巳 | 大阪大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 33 | 2004B0858-NL1-np-P3k | ユビキチン活性化酵素E1の結晶構造解析 | 森本 幸生 | 京都大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 34 | 2004B0859-NL1-np-P3k | アーキロドプシンファミリーのX線結晶構造解析 | 神山 勉 | 名古屋大学 | 日本 | BL38B1 | 6 |
| 35 | 2004B0864-NL1-np-P3k | 分裂酵母セリンラセマーゼのX線構造解析 | 後藤 勝 | 大阪大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 36 | 2004B0866-NL1-np-P3k | トレオニン合成酵素のX線構造解析 | 近江 理恵 | 大阪市立大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 37 | 2004B0867-NL1-np-P3k | ペルオキシソーム挿入型膜タンパク質の輸送に関わるタンパク質装置の構造機能解明 | 加藤 博章 | 京都大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 38 | 2004B0868-NL1-np-P3k | ペルオキシソーム挿入型膜タンパク質の輸送に関わるタンパク質装置の構造機能解明 | 加藤 博章 | 京都大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 39 | 2004B0871-NL1-np-P3k | プロスタグランジン合成酵素の基質類似物複合体の構造解析 | 井上 豪 | 大阪大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 40 | 2004B0873-NL1-np-P3k | 翻訳関連蛋白質群のX線結晶構造解析 | 角田 佳充 | 九州大学 | 日本 | BL38B1 | 6 |
| 41 | 2004B0874-NL1-np-P3k | 翻訳関連蛋白質群のX線結晶構造解析 | 角田 佳充 | 九州大学 | 日本 | BL41XU | 6 |
| 42 | 2004B0876-NL1-np-P3k | 「発生・分化とDNAの複製・修復」に関わるタンパク質の立体構造解析 | 田之倉 優 | 東京大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 43 | 2004B0878-NL1-np-P3k | 「発生・細胞分化」に関わるタンパク質の立体構造解析 | 永田 宏次 | 東京大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 44 | 2004B0882-NL1-np-P3k | タンパク3000プロジェクト（翻訳後修飾と輸送） | 若槻 壮市 | 高エネルギー加速器研究機構 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 45 | 2004B0883-NL1-np-P3k | イネ由来の植物クラスIキチナーゼのX線結晶構造解析 | 野中 孝昌 | 長岡技術科学大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 46 | 2004B0885-NL1-np-P3k | 大腸菌由来Ada蛋白質のメチル化依存性機能スイッチメカニズムの研究 | 大久保 忠恭 | 大阪大学 | 日本 | BL38B1 | 3 |
| 47 | 2004B0886-NL1-np-P3k | 大腸菌由来Ada蛋白質のメチル化依存性機能スイッチメカニズムの研究 | 大久保 忠恭 | 大阪大学 | 日本 | BL41XU | 3 |
| 48 | 2004B0930-NL1-np-P3k | 膜蛋白質分解メタルプロテアーゼFtsHのX線結晶構造解析 | 吉田 賢右 | 東京工業大学 | 日本 | BL40B2 | 3 |
| 49 | 2004B0931-NL1-np-P3k | プロスタグランジン合成酵素の基質類似物複合体の構造解析 | 井上 豪 | 大阪大学 | 日本 | BL40B2 | 3 |
| 50 | 2004B0932-NL1-np-P3k | 高度高熱菌由来BirAの結晶構造 | 今野 美智子 | お茶の水女子大学 | 日本 | BL40B2 | 3 |
| 51 | 2004B0933-NL1-np-P3k | 低温環境生物タンパク質の結晶構造解析に関する研究 | 渡邉 啓一 | 佐賀大学 | 日本 | BL40B2 | 3 |
| 52 | 2004B0934-NL1-np-P3k | 神経系をはじめとするタンパク質群の結晶構造解析 | 片柳 克夫 | 広島大学 | 日本 | BL40B2 | 3 |
| 53 | 2004B0935-NL1-np-P3k | メッセンジャーRNAの生成（転写）制御、成熟化と輸送、並びに遺伝情報維持に関わるタンパク質の構造生物学 | 山縣 ゆり子 | 熊本大学 | 日本 | BL40B2 | 3 |
| 54 | 2004B0936-NL1-np-P3k | 鉄硫黄タンパク質の成熟化に関与するタンパク質群の構造解析 | 福山 恵一 | 大阪大学 | 日本 | BL40B2 | 3 |